崩坏星穹铁道空间站黑塔宝箱主要分散在基座舱段、收容舱段、支援舱段、主控舱段和禁闭舱段五大分区，大量宝箱藏在电梯夹层、隐藏密闭房间、桥梁解谜区域、任务后续空间以及怪物镇守的偏僻角落，其中收容舱段二层、基座舱段的权限房间、禁闭舱段二层的踩格子谜题位置是玩家最容易漏掉宝箱的核心区域，完成对应前置条件、解开机关谜题或者击败镇守怪物之后，才可以拿到全部战利品宝箱与次元扑满奖励。
基座舱段一共包含11个宝箱和1只次元扑满，普通宝箱大多分布在主通道两侧的平台、楼梯下方以及通道尽头，最难获取的贵重战利品宝箱藏在地图右上角的封闭房间之内，想要打开这间密室，需要集齐三张特许通行证，先在主控舱段商店旁边和爆炸头NPC完成五次对话拿到第一张钥匙，接着击败基座舱段右上角的精英怪物获取第二张钥匙，最后前往收容舱段最左侧的闪光点完成对话拿到第三张钥匙，集齐全部钥匙开启密室大门，清理房间内的敌人之后就能开启宝箱；剩下的宝箱沿着通道依次推进，留意左右两侧被墙体遮挡的平台，顺着楼梯向下探索夹层空间，就能收集剩余战利品。
收容舱段拥有20个宝箱，分为一层和二层两个楼层，一层的宝箱大部分分布在环形大厅外围通道，最左侧房间内的贵重宝箱很容易被忽略，二层宝箱的获取难度大幅提升，多处宝箱需要解开红蓝互斥桥机关和踩格子谜题，调整桥梁开关的开启顺序，先启动白色桥梁，再切换红蓝通道连通道路才能抵达宝箱位置。支援舱段的宝箱大多绑定支线任务，做完人非草木和触不可及全部流程之后，通往隐藏房间的通道才会解锁，清理沿途镇守的敌人即可开启宝箱；主控舱段仅有1个不计入成就的宝箱，位置在三角形地图最内侧的走廊深处，不需要解谜，抵达点位就可以直接开启。
禁闭舱段新增的12个宝箱集中分布在二层和三层，三层集散中心旁边有2个基础宝箱，乘坐电梯来到二层之后，药物制备间附近散落着大量战利品，地图右下角的踩格子机关宝箱是该区域最大难点，按照地面平台顺序依次踏上对应方格，完成全部解谜之后宝箱就会解锁，温床区域附近还有次元扑满，快速打掉扑满拿到额外星琼奖励。不少玩家开启传送锚点之后只走主线路线，忽略电梯切换楼层、内侧分支房间和墙体后方的隐蔽点位，即便地图显示探索进度接近完成，依旧会漏掉3‑5个宝箱，收集时需要频繁切换楼层，打开地图核对每个角落的可通行区域，避免错过隐藏通道。
玩家收集宝箱时可以采用由高楼层到低楼层的探索顺序，优先解锁全部传送锚点，优先做完空间站内所有支线任务，解开权限机关之后再逐个清理宝箱；普通战利品可以借助大黑塔的寻宝秘技快速定位，解谜宝箱和强敌镇守宝箱没办法依靠道具搜寻，只能对照舱段分区逐一排查。开启宝箱可以收获大量星琼、黑塔币、冒险记录素材，全部宝箱收集完成之后还能解锁对应的探索成就，长期游玩可以依靠这些资源抽取角色和光锥，大幅提升账号养成进度。
